RT-MLPSEQ : Une nouvelle technologie pour caractériser les cancers Expression génétique et transcrits de fusion
La solution RT-MLPSeq personnalisée de CliniSciences et GeneXpath vous permet d’évaluer le niveau d’expression des ARN messagers (ARNm) ou la présence de transcrits de fusion de 10 à 100 marqueurs d’intérêt de votre choix.
Solution Personnalisée RT-MLPSeq de CliniSciences et GeneXpath
Dans les projets de recherche, les études précliniques et cliniques, il est souvent nécessaire d’obtenir les niveaux d’expression génique ou de détecter des transcrits de fusion pour plusieurs dizaines de marqueurs. Aujourd’hui, l’analyse de l’expression relative et des transcrits de fus
Solution Personnalisée de GeneXpath
La solution personnalisée de GeneXpath permet de sélectionner rapidement et facilement vos marqueurs d’intérêt. Une fois vos choix établis, nous vous fournissons une solution clé en main : un test in vitro et une analyse bio-informatique après séquençage NGS.
Ces panels personnalisés peuvent être développés pour tout type de génome. Nous pouvons produire des panels contenant entre dix et cent marqueurs.
Avantages de RT-MLPSeq :
- Protocole simple et rapide : Manipulations réalisables en une demi-journée.
- Faible quantité de matériel nécessaire : 50 à 500 ng d’ARN, extraits d’échantillons frais, congelés ou FFPE (tissus, liquides, etc.). Optimisé pour les échantillons FFPE.
- Pas de purification nécessaire avant préparation des bibliothèques : Réduit les pertes et garantit une excellente sensibilité.
- Technique robuste : Fiabilité démontrée dans des contextes variés.
Applications Diagnostiques en Oncologie :
- Caractérisation des lymphomes non hodgkiniens : Basée sur l’expression de plus de 130 gènes avec notre test LymphoSign (CE-IVD).
- Caractérisation des lymphomes T périphériques : Identification des transcrits de fusion via notre test LymphoTranscript.
- Caractérisation des sarcomes : Analyse de plus de 140 transcrits de fusion avec notre test SarcomaFusion (CE-IVD).
RT-MLPSeq : Protocole Rapide et Facile
- Le test in vitro inclut 4 étapes, réalisables en une demi-journée, avec 1h à 1h30 de manipulations actives.
- Le séquençage NGS requiert seulement 100 000 lectures par échantillon.
- Les bibliothèques peuvent être séquencées avec d’autres échantillons. Les codes-barres nécessaires sont inclus dans le kit.
- Un gain de temps significatif pour vos projets.
Analyse Informatique Robuste et Efficace
Après le séquençage, il vous suffit de télécharger le fichier FASTQ sur la plateforme GeneXpath. En quelques minutes, vous obtenez un fichier contenant les données brutes et l’expression relative de chaque marqueur dans le panel.
Sur demande, RT-MIS génère des graphiques personnalisés pour une interprétation simplifiée des résultats.